Хогвартс готовится к очередным школьным событиям, но для Гарри, Рона и Гермионы учебный год превращается в настоящее расследование. После того как друзья узнают больше о философском камне, они пытаются выяснить, кто стоит за попыткой проникнуть к нему. Однако неожиданная встреча с троллем заставляет их забыть о собственных подозрениях. Когда опасное существо оказывается в замке, Гарри и Рон бросаются на помощь Гермионе, оказавшейся в ловушке. Вместе им удаётся остановить тролля, но после этого троица понимает, что теперь их связывает нечто большее, чем обычная дружба. Тем временем Гарри замечает странные события вокруг профессора Снейпа и всё больше убеждается, что именно он может быть связан с тайной философского камня. Герои начинают изучать старые книги и искать сведения о Николасе Фламеле, пытаясь понять, почему этот человек настолько важен для их расследования. Чем ближе друзья подходят к разгадке, тем очевиднее становится, что опасность находится совсем рядом, а в Хогвартсе кто-то действует втайне от всех.